日本黑漆描金山水大笔筒
清前期中日文化交流，还表现在当时中国的学术影响了日本的学术界。以考据著称的乾嘉学派，在清代学术史上占有重要地位。这个学派的考据学风对日本学术界产生了影响。从日本学者太田锦城（1765—1825年）在其著述中引用中国学者曹溶所编《学海类编》看，不仅乾嘉学派，而且清初的考据学者阎若璩等人也都对日本学术界产生了影响。正是在清前期考据学的影响下，日本学术界出现了考证学派。这个学派崇信古典，埋头于日本历史、日本文学文献的考证，有的人甚至对药物学、民俗学也进行考证。清前期编辑的许多大型图书传到日本后，对日本的编书事业也产生了影响。日本长达三千部的《群书类丛》《续群书类丛》，就是在清前期《古今图书集成》影响下编成的。江户幕府纂修的《法度书》、《公事方御定书》，也是受了清前期康熙朝《大清会典》的影响。
还应当指出的是，清前期许多中国画家前往日本，对日本的绘画界产生了影响。伊孚九擅长中国南宗山水画，风格清新。他到日本后，影响了日本画家池大雅、与谢芜村等人。池大雅、与谢芜村通过向伊孚九学习，成为日本著名的画家。沈南蘋是写生大师，他画的花卉精致艳丽。雍正九年至十一年（1731—1733年）间，沈南蘋留居日本，向日本画界传授画法，结果，长崎译官熊代绣江以及圆山应举等人，通过向他学习，技艺明显长进，并影响了更多的日本画家，以致日本画界产生了写生画中的南蘋派。[38]